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文献深度测序揭示肝癌患者舌苔菌群
研究背景
肝癌(LC)是一种常见的恶性肿瘤,发病率和死亡率较高。已有很多研究表明肠道微生物与肝硬化、肝癌及其并发症的发生与发展有密切关联,而肠道中微生物又是通过“口”入的。因此可以推测口腔微生物的改变与肝炎、肝癌等也有关联。随后有研究发现口腔微生物确实可以一定程度上反映肝性脑病患者的肠道微生物变化,失调时会导致疾病的发生,但是对肝癌患者的口腔微生物还知之甚少。本研究是首次利用16SrRNA测序手段对肝癌患者的舌苔微生物进行研究。根据中医的“全息理论”,脸上的“五官”(口、眼、耳、鼻、舌)表现也与人体的“五脏”(心、肝、脾、肺、肾)健康状况息息相关,如果可以找到肝癌患者与健康人的舌苔微生物的差异标志物,将会为肝癌的诊断和治疗提供有意义的指导。
样本选取35名早期肝癌(肝硬化)患者和25名健康人的舌苔样本。
研究结果1、患者和健康人的微生物组成有明显差异,并且患者组的微生物多样性更丰富
为了检测患者和健康组舌苔微生物组的多样性与差异,分别采用不同的微生物多样性指数评估。Shannon、Simpson、invSimpson、Obs、Chao1、ICE(Incidence-basedCoverageEstimators)均表明患者的微生物多样性更高(图c,图d);基于unweighted(图a)weighted(图b)UniFracPCA分析发现,患者与健康组的舌苔微生物组成显著不同。
2、患者和健康组的优势微生物类群—门水平
物种组成分析发现患者的最多的微生物是Bacteroidetes,Proteobacteria,Firmicutes和Fusobacteria,患者和健康人的共有优势物种主要有10个门(图a),占比分别为90%和94%(图b)。健康人的Bacteroidetes更丰富,患者的Fusobacteria、Actinobacteria和SR1比健康人的多。
3、患者和健康组间的显著差异微生物比较
通过前述PCA、微生物多样性等分析发现,患者和健康组舌苔微生物显著不同,但具体是哪些物种造成了差异呢,LEfSe分析发现患者组的主要差异物种是Fusobacteria、Clostridia、Actinobacteria、Epsilonproteobacteria和SR1;健康组则是主要为:Bacteroidetes和Gammaproteobacteria(LDAScore(log10)3)。两个微生物标志物Oribacterium、FusobacteriumAUC分别是0.、0.,具有很好的预测作用。
研究结论早期肝癌患者的舌苔微生物与健康人的显著不同,Oribacterium、Fusobacterium可作为肝癌的微生物标志物,为肝病的临床诊断和治疗具有指导作用。
参考文献:
LuH,RenZ,LiA,etal.Deepsequencingrevealsmicrobiotadysbiosisoftonguecoatinpatientswithlivercarcinoma[J].ScientificReports,,6.